More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1335 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  833    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 426 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  31.15 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 434 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 422 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 413 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  31.31 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 439 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  32.7 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  26.96 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 421 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5076  major facilitator superfamily permease protein  26.39 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  26.72 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  24.93 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.63 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.69 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  28.2 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  28.69 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5218  Permeases of the major facilitator superfamily  26.04 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  27.51 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  26.8 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.25 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 421 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  23.43 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  25.85 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  23.5 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  27.61 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>