More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0492 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  96.44 
 
 		 423 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  100 
 
 		 422 aa  791    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  92.16 
 
 		 420 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  96.44 
 
 		 423 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  87.04 
 
 		 439 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  91.27 
 
 		 424 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  86.34 
 
 		 459 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  67.23 
 
 		 430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  32.23 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  30.44 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  28.09 
 
 		 410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.7 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.61 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.53 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  25.07 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.27 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.27 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  26.87 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.95 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.07 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.46 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.34 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.46 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.75 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.97 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.75 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.47 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28.08 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  29.03 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.46 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  30.29 
 
 		 427 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.02 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  27.85 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.88 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>