146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3237 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  828    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  78.24 
 
 		 417 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  64.51 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 		 410 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 408 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 432 aa  206  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 408 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  31.99 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  32.04 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 416 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  31.22 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 411 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  31.66 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 369 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  32.02 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  30.86 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  29.69 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 397 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  34.78 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  27.46 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  33.21 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  30.93 
 
 		 216 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  29.26 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1997  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  23.65 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28.89 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  23.79 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.88 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  25.56 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  23.14 
 
 		 404 aa  57  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>