127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1916 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  714    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  82.34 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  85.45 
 
 		 391 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  75.71 
 
 		 386 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  60.26 
 
 		 387 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  62.95 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  68.22 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  61.26 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  60.16 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  50.15 
 
 		 389 aa  292  8e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 369 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  48.9 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 397 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  45.09 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 402 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 402 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  44.2 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  36.17 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  36.31 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  31.76 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 411 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 369 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  32.33 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  34.76 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  31.94 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 401 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  31.75 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  32.26 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 414 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.48 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  30.51 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  30 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  46.77 
 
 		 151 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 442 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.28 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  29.91 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  24.9 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  29.49 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 436 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 472 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  32.98 
 
 		 528 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>