94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1344 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  100 
 
 		 414 aa  790    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  45.53 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 400 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 426 aa  133  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 402 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  29.89 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  27.81 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 433 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  25.66 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  25.66 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  27.2 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  24.35 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  34.12 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  28.29 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  26.69 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.35 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  31.75 
 
 		 216 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  28.44 
 
 		 480 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  26.34 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  25.38 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  25 
 
 		 485 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  25 
 
 		 485 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  25 
 
 		 485 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  25 
 
 		 485 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  25 
 
 		 485 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  25 
 
 		 485 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  25 
 
 		 485 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  25 
 
 		 485 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  28.45 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1791  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0460445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>