113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2518 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 397 aa  750    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  98.24 
 
 		 400 aa  733    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  54.22 
 
 		 397 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  49.34 
 
 		 393 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  50.14 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  38.3 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 408 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  34.97 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  32.87 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  31.59 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  32.87 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  39.88 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  30.29 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  30.64 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  31.7 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  32.56 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.45 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254486  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  25.27 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.32 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.62 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  24.9 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  22.75 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  22.75 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>