121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4051 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  813    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  82.86 
 
 		 391 aa  564  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  81.51 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  73.89 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  59.73 
 
 		 387 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  60.66 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  55.1 
 
 		 408 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  59.83 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  65.92 
 
 		 404 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 389 aa  289  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  44.18 
 
 		 411 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  45.24 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  41.31 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 393 aa  223  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  41.31 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  41.51 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  35.45 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  34.58 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  30.93 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 369 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 432 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  31.51 
 
 		 402 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  31.51 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  30.66 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  28.89 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 403 aa  89.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 385 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  30.84 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  31.35 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  28 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 433 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 403 aa  53.5  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  27.65 
 
 		 216 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  40.74 
 
 		 151 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  23.36 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  23.38 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 394 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 408 aa  46.6  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  27.04 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>