More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1136 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  784    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  59.22 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  60.1 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  61.68 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  66.76 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  63.86 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  64.19 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  66.76 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  57.54 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  63.79 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  58.79 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  56.36 
 
 		 402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  59.13 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  55.99 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  58.93 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  54.21 
 
 		 410 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  54.95 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  59.57 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  57.63 
 
 		 409 aa  391  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  61.58 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  56.88 
 
 		 411 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  57.07 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  54.67 
 
 		 397 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  55.06 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  59.47 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 		 433 aa  308  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  50.67 
 
 		 384 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  50.14 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 		 395 aa  295  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  49.86 
 
 		 403 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  49.86 
 
 		 403 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  50 
 
 		 403 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  51.69 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 400 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  50.14 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  49 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 408 aa  282  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  47.34 
 
 		 413 aa  279  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  47.62 
 
 		 376 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  42.06 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  42.06 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  42.06 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  41.78 
 
 		 451 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 		 412 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  42.06 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  41.78 
 
 		 451 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  42.06 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 401 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  37.71 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 402 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 735 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  32.38 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  35.37 
 
 		 408 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  34.36 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 422 aa  140  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  31.3 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  30.74 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 397 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  30.15 
 
 		 398 aa  119  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  29.01 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  29.01 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.38 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  29.01 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  29.01 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  29.01 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  30.18 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  26.74 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  27.3 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  30.41 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>