More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2319 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 396 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  51.65 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  57.54 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  50.54 
 
 		 404 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  53.44 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  53.89 
 
 		 404 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  48.88 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  52.09 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  52.09 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  49.19 
 
 		 408 aa  319  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 		 407 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  51.67 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 		 416 aa  308  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 		 410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  47.11 
 
 		 410 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  47.01 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 376 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  45.73 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 409 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  44.7 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 403 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  43.41 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  38.8 
 
 		 451 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  38.8 
 
 		 451 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  38.8 
 
 		 451 aa  258  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  38.8 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  38.8 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 412 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  39.52 
 
 		 394 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  37.43 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  42.29 
 
 		 376 aa  246  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 413 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  35.39 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 412 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  30.36 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 415 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 735 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 413 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 408 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  30.17 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 403 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  31.65 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  30.08 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  29.85 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  30.13 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  26.85 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  26.82 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  28.57 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  27.25 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  25.14 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  27.48 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  24.86 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  24.34 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  24.34 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  24.34 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  24.34 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>