More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2226 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  100 
 
 
396 aa  769    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  41.56 
 
 
398 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  41.64 
 
 
388 aa  279  5e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  43.87 
 
 
396 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  43.87 
 
 
396 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  43.87 
 
 
396 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  40.87 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  43.6 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  42.59 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  41.71 
 
 
399 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  43.38 
 
 
389 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  43.6 
 
 
396 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  41.76 
 
 
396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  43.1 
 
 
394 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  42.37 
 
 
396 aa  264  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  42.37 
 
 
396 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  42.37 
 
 
396 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 
396 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  42.37 
 
 
396 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  42.37 
 
 
396 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  42.37 
 
 
396 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  42.37 
 
 
396 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  42.37 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  39.38 
 
 
376 aa  262  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  41.26 
 
 
396 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  43.89 
 
 
419 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  42.08 
 
 
417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  43.91 
 
 
395 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  42.7 
 
 
393 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  38.92 
 
 
410 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  38.92 
 
 
394 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  38.96 
 
 
394 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  38.8 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
390 aa  242  9e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  39.19 
 
 
400 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  39.19 
 
 
451 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  38.92 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  42.16 
 
 
402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  39.13 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  41.76 
 
 
407 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  42.66 
 
 
395 aa  229  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  42.33 
 
 
395 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  39.52 
 
 
413 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  39.62 
 
 
405 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  38.53 
 
 
399 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  39.04 
 
 
408 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  38.82 
 
 
399 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  34.27 
 
 
397 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  33.75 
 
 
404 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  33.75 
 
 
404 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  33.75 
 
 
404 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  33.75 
 
 
404 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  33.75 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  33.75 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  33.16 
 
 
404 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  33.16 
 
 
404 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  33.08 
 
 
415 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  32.99 
 
 
404 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  34.6 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  32.58 
 
 
415 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  32.58 
 
 
404 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  32.9 
 
 
392 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  32.24 
 
 
404 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.43 
 
 
388 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  33.16 
 
 
391 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  32.73 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  32.73 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  32.73 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  32.56 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.03 
 
 
391 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
390 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  32.64 
 
 
391 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  32.95 
 
 
390 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.98 
 
 
391 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
390 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
390 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
390 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  33.62 
 
 
390 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  31.51 
 
 
400 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  33.62 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  33.33 
 
 
390 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  32.74 
 
 
400 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  32.47 
 
 
391 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  32.56 
 
 
416 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.45 
 
 
391 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  32.11 
 
 
400 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  30.99 
 
 
400 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  32.11 
 
 
400 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  31.85 
 
 
400 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  34.32 
 
 
396 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
412 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  32.45 
 
 
391 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 
317 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  32.73 
 
 
400 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  32.3 
 
 
391 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  30.42 
 
 
406 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
391 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  34.22 
 
 
397 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>