More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2011 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  785    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  67.03 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  66.4 
 
 		 404 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  65.44 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  65.44 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  58.46 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  58.68 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  59.73 
 
 		 411 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  59.07 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  60.26 
 
 		 402 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  60.45 
 
 		 408 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  60.71 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  55.15 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  57.03 
 
 		 416 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  58.24 
 
 		 410 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  57.42 
 
 		 410 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  55.1 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  56.76 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  53.52 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  56.99 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  53.73 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  51.24 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  52.49 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  52.77 
 
 		 420 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  52.96 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  47.68 
 
 		 400 aa  295  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  49.04 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  49.43 
 
 		 384 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 400 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 413 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  46.32 
 
 		 395 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 403 aa  272  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  47.01 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  42.94 
 
 		 400 aa  259  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  38.01 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  37.2 
 
 		 451 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  37.2 
 
 		 451 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  37.2 
 
 		 451 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  37.2 
 
 		 451 aa  242  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  37.2 
 
 		 451 aa  242  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  37.33 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 418 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 397 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  37.71 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 394 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  35.46 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  32.91 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 408 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 390 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  34.26 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 735 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  29.74 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 397 aa  133  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 390 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  26.53 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  29.55 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  28.17 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  33.21 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  30.65 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  28.7 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  30.83 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  29.35 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  30.83 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  30.83 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>