More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2353 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  794    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  93.64 
 
 
395 aa  692    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  59.73 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  59.47 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  62.75 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  62.13 
 
 
400 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  62.13 
 
 
400 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  63.4 
 
 
379 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  56.71 
 
 
401 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  61.33 
 
 
403 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  61.14 
 
 
399 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  52.28 
 
 
400 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  47.59 
 
 
408 aa  335  7.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  45.69 
 
 
394 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  45.2 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  45.2 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  45.2 
 
 
451 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  45.2 
 
 
451 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  45.2 
 
 
451 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 
412 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  45.2 
 
 
396 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  46.91 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  47.31 
 
 
402 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  47.5 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  44.06 
 
 
398 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  44.04 
 
 
404 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  44.01 
 
 
402 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
410 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  42.44 
 
 
410 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  47.5 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  47.5 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  45.08 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  45.25 
 
 
404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 
408 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  43.77 
 
 
402 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  42.03 
 
 
400 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  42.86 
 
 
397 aa  279  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
409 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
411 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 
407 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  44.88 
 
 
420 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  46.2 
 
 
402 aa  276  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 
403 aa  273  6e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  44.29 
 
 
401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 
400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  42.47 
 
 
376 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 
416 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  44.01 
 
 
398 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  44.01 
 
 
398 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 
433 aa  256  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  44.97 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
384 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  45.03 
 
 
402 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 
396 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  43.09 
 
 
376 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 
397 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  40.22 
 
 
402 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
412 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  37.89 
 
 
418 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 
395 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 
402 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  36.52 
 
 
408 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  36.49 
 
 
406 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  34.16 
 
 
415 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  39.2 
 
 
394 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 
415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  36.54 
 
 
408 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  36.78 
 
 
408 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  36.26 
 
 
413 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  36.16 
 
 
407 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 
390 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 
735 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
402 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
390 aa  173  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 
398 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  33.25 
 
 
410 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
422 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  33.14 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  33.89 
 
 
397 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  32.75 
 
 
404 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.97 
 
 
404 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  31.48 
 
 
399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  36.13 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  30.41 
 
 
399 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  31.44 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  31.82 
 
 
417 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  29.49 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  29.49 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  30.97 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  31.71 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  29.61 
 
 
398 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  33.84 
 
 
402 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  29.65 
 
 
404 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  29.65 
 
 
404 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  29.58 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  32.65 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  33.08 
 
 
410 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  34.1 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>