More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0868 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  90.98 
 
 
399 aa  679    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  100 
 
 
399 aa  781    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  83.11 
 
 
376 aa  618  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  58.87 
 
 
398 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  53.4 
 
 
398 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  52.62 
 
 
396 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  52.62 
 
 
396 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  52.62 
 
 
396 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  52.62 
 
 
396 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  52.62 
 
 
396 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  53.66 
 
 
396 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  53.14 
 
 
396 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  53.4 
 
 
396 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  51.27 
 
 
419 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  53.4 
 
 
396 aa  359  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  53.4 
 
 
396 aa  359  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  53.4 
 
 
396 aa  359  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  53.4 
 
 
396 aa  359  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  53.4 
 
 
396 aa  359  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  53.4 
 
 
396 aa  359  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  49.6 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  48.84 
 
 
396 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  50.13 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  49.61 
 
 
395 aa  332  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  48.14 
 
 
407 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  48.83 
 
 
395 aa  329  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  45.05 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  49.1 
 
 
393 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  50.26 
 
 
413 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  49.23 
 
 
399 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  49.46 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  48.26 
 
 
390 aa  318  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  49.21 
 
 
408 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  48.52 
 
 
407 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  50.92 
 
 
399 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  44.27 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  43.3 
 
 
389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  43.62 
 
 
394 aa  306  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  46.61 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  44.86 
 
 
417 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  44.35 
 
 
394 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  42.9 
 
 
394 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  41.38 
 
 
396 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  42.56 
 
 
410 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  42.63 
 
 
400 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  42.63 
 
 
451 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  42.36 
 
 
400 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  30.1 
 
 
397 aa  173  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
404 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  32.53 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  32.53 
 
 
391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  32.53 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  32.53 
 
 
391 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
390 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  32.95 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  32.95 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  32.95 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  32.95 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  32.95 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  29.67 
 
 
404 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  29.67 
 
 
404 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  29.67 
 
 
404 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  32.95 
 
 
390 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  29.67 
 
 
404 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.99 
 
 
391 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31 
 
 
400 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.67 
 
 
404 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  32.66 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  31.79 
 
 
392 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.41 
 
 
404 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.03 
 
 
391 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30.15 
 
 
415 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
404 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  31.77 
 
 
391 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
415 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
412 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.08 
 
 
388 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  30.57 
 
 
414 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  31.88 
 
 
391 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  30.89 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.34 
 
 
391 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
388 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
402 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  32.09 
 
 
400 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.53 
 
 
404 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  31.05 
 
 
389 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  31.05 
 
 
389 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  31.05 
 
 
389 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  31.05 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  30.67 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  29.29 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.34 
 
 
391 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  34.6 
 
 
407 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  31.95 
 
 
401 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 
317 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  31.71 
 
 
388 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  29.05 
 
 
404 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  32.34 
 
 
391 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  31.71 
 
 
388 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>