More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0388 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 390 aa  759    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  54.47 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  53.85 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  53.05 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  53.05 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  53.05 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  53.05 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  52.79 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  53.44 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  55.17 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  51.77 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  52.52 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  52.79 
 
 		 396 aa  352  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  52.52 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  52.52 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  52.52 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  52.52 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  52.52 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  52.52 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  52.52 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  54.87 
 
 		 399 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  55.17 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  54.6 
 
 		 408 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  47.57 
 
 		 376 aa  345  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  54.04 
 
 		 413 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  53.06 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  48.82 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  50.76 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  47.85 
 
 		 388 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  47.03 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  47.88 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  50.46 
 
 		 405 aa  332  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  50.95 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  44.77 
 
 		 397 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  52.91 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  50.3 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  48.3 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  45.23 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  43.89 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  44.41 
 
 		 410 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  44.65 
 
 		 400 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  44.65 
 
 		 451 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  44.65 
 
 		 400 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  45.68 
 
 		 417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  44.6 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  43.5 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  42.01 
 
 		 396 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 392 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 391 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  29.64 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  29.64 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  29.64 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  30.33 
 
 		 404 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 401 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 412 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.38 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  29.12 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 404 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  29.97 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  32 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  28.34 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  30.75 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.02 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  30.75 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.75 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  30.99 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>