More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1932 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  100 
 
 
388 aa  753    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  54.52 
 
 
398 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  52.93 
 
 
396 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  52.93 
 
 
396 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  52.93 
 
 
396 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  52.93 
 
 
396 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  52.66 
 
 
396 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  52.79 
 
 
396 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  53.83 
 
 
419 aa  358  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  52.65 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  49.08 
 
 
398 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  54.72 
 
 
396 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  54.45 
 
 
396 aa  348  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  54.45 
 
 
396 aa  348  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  54.45 
 
 
396 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  54.45 
 
 
396 aa  348  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  54.45 
 
 
396 aa  348  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  54.45 
 
 
396 aa  348  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  54.45 
 
 
396 aa  348  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  54.45 
 
 
396 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  52.09 
 
 
395 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  51.57 
 
 
395 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  51.59 
 
 
407 aa  339  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  53.44 
 
 
402 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  48.49 
 
 
397 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  52.89 
 
 
413 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  52.78 
 
 
407 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  52.58 
 
 
408 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  51.94 
 
 
395 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  51.84 
 
 
399 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  47.45 
 
 
376 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  46.7 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  45.05 
 
 
399 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  51.54 
 
 
405 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  47.85 
 
 
390 aa  308  9e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  46.01 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  52.37 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  46.5 
 
 
410 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  45 
 
 
394 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  46.28 
 
 
393 aa  299  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  48.16 
 
 
417 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  45.28 
 
 
400 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  46.03 
 
 
451 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  45.28 
 
 
400 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  41.34 
 
 
394 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  41.44 
 
 
389 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  41.64 
 
 
396 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  32.16 
 
 
415 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  33.61 
 
 
404 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  33.61 
 
 
415 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  29.81 
 
 
397 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
404 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  29.95 
 
 
404 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  29.95 
 
 
404 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.95 
 
 
404 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  29.95 
 
 
404 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  29.95 
 
 
404 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  32.4 
 
 
404 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  31.17 
 
 
404 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.69 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
394 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
403 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  30.81 
 
 
404 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  28.97 
 
 
391 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  32.28 
 
 
408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  28.72 
 
 
391 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.4 
 
 
391 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  30.08 
 
 
408 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  31.01 
 
 
396 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  31.25 
 
 
385 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  32.29 
 
 
389 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  32.29 
 
 
389 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  28.03 
 
 
407 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  28.46 
 
 
391 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  28.93 
 
 
383 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  28.72 
 
 
391 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  28.35 
 
 
418 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
398 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  32 
 
 
389 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  32.4 
 
 
409 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  27.56 
 
 
390 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
388 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  30.03 
 
 
406 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  30.95 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  28.69 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.36 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  28.53 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  27.27 
 
 
390 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.01 
 
 
391 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  28.17 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  27.27 
 
 
390 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  31.59 
 
 
391 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
404 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>