More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1610 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  100 
 
 
396 aa  776    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  99.49 
 
 
396 aa  771    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
396 aa  776    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  99.75 
 
 
396 aa  775    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  100 
 
 
396 aa  776    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  776    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  99.75 
 
 
396 aa  775    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  100 
 
 
396 aa  776    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  87.12 
 
 
396 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
398 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  100 
 
 
396 aa  776    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  65.28 
 
 
419 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  65.68 
 
 
395 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  59.62 
 
 
396 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  60.05 
 
 
396 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  59.95 
 
 
407 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  61.08 
 
 
393 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  62.11 
 
 
395 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  61.24 
 
 
395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  54.18 
 
 
376 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  59.51 
 
 
402 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  53.99 
 
 
388 aa  392  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  59.89 
 
 
407 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  60.17 
 
 
413 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  53.51 
 
 
398 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  59.89 
 
 
408 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  52.58 
 
 
399 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  53.4 
 
 
399 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  59.61 
 
 
399 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  58.2 
 
 
405 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  50.82 
 
 
397 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  52.52 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  49.59 
 
 
394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  57.7 
 
 
399 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  48.92 
 
 
394 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  49.19 
 
 
410 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  50.84 
 
 
417 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  50.53 
 
 
400 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  50.53 
 
 
451 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  50.53 
 
 
400 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  51.15 
 
 
389 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  48.74 
 
 
394 aa  322  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  42.19 
 
 
396 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  34.12 
 
 
397 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  32.03 
 
 
415 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
415 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  32.03 
 
 
404 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.77 
 
 
404 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  32.99 
 
 
418 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  30.4 
 
 
404 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  31.78 
 
 
404 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.23 
 
 
391 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.51 
 
 
391 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
404 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
404 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  30.15 
 
 
404 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
404 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 
403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.96 
 
 
391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.23 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.23 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  29.62 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.9 
 
 
404 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.81 
 
 
404 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  30.98 
 
 
394 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  30.73 
 
 
404 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  31.57 
 
 
393 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
412 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  32.39 
 
 
391 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.08 
 
 
388 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
398 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
388 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.63 
 
 
391 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.97 
 
 
391 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.7 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
390 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
390 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
390 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
390 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
390 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  32.67 
 
 
390 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  34.27 
 
 
407 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
404 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  31.91 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  30.52 
 
 
406 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  32.39 
 
 
390 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.56 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  30.27 
 
 
392 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  32.36 
 
 
416 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  31.65 
 
 
408 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  32.36 
 
 
391 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  32.08 
 
 
389 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  32.94 
 
 
391 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  32.39 
 
 
390 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>