More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0823 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  99.49 
 
 		 389 aa  746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  97.69 
 
 		 389 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  748    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  94.86 
 
 		 389 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  85.45 
 
 		 389 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  85.45 
 
 		 389 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  85.45 
 
 		 389 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  85.45 
 
 		 389 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  85.01 
 
 		 389 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  85.45 
 
 		 389 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  85.45 
 
 		 389 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  85.79 
 
 		 389 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  82.07 
 
 		 388 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  82.34 
 
 		 388 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  78.8 
 
 		 385 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  62.57 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  62.29 
 
 		 390 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  62.29 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  62.29 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  62.29 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  62.29 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  62.29 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  62.83 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  62.85 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  60.26 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  62.17 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  59.47 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  59.52 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  60.05 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  59.52 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  59.52 
 
 		 391 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  62.29 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  60.61 
 
 		 392 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  57.89 
 
 		 408 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  61.41 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  59.42 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  59.54 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  57.52 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  58.26 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  58.26 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  55.64 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  54.62 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  59.5 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  58.59 
 
 		 391 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  58.59 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  50.91 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  52.71 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  55.35 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  55.73 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  56.33 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  58.12 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  58.12 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  58.12 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  53.89 
 
 		 405 aa  349  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  55.67 
 
 		 388 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  57.98 
 
 		 388 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  53.66 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  56.25 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 409 aa  328  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  50.97 
 
 		 378 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  50.55 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  49.28 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 391 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  51.86 
 
 		 391 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  51.86 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  48.57 
 
 		 400 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  50.14 
 
 		 390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  49.34 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  46.25 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  49.74 
 
 		 408 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  50.14 
 
 		 389 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  44.78 
 
 		 391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  44.68 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  44.53 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  44.27 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.53 
 
 		 388 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 		 406 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  44.02 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 391 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  43.75 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  45.43 
 
 		 395 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  44.27 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  43.38 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  43.38 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  43.38 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  43.38 
 
 		 404 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  47.03 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  45.53 
 
 		 393 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>