More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0999 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  100 
 
 		 407 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  92.86 
 
 		 402 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  67.93 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  69.21 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  67.49 
 
 		 405 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  69.27 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  69 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  69.09 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  58.72 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  67.77 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  59.34 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  63.93 
 
 		 407 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  58.21 
 
 		 396 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  58.46 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  58.46 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  58.46 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  58.66 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  60.21 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  59.78 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  59.51 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  59.51 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  59.51 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  59.51 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  59.51 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  58.31 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  59.51 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  59.51 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  51.9 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  59.51 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  51.95 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  53.01 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  50.39 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  58.58 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  53.39 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  58.24 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  51.05 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  49.36 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  49.36 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  49.1 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  50.53 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  50.41 
 
 		 376 aa  355  5e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  50.82 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  47.79 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  49.58 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  48.9 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  46.69 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  41.69 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  31.42 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  31.27 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 415 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  31.27 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.27 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  31.66 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 391 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  30.3 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  30.3 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  30.3 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  30.3 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  31 
 
 		 404 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 404 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  32.34 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  30.37 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  32 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.54 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.54 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>