More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3070 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  91.48 
 
 		 408 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  92.48 
 
 		 399 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  100 
 
 		 399 aa  766    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  91.48 
 
 		 413 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  73.28 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  72.54 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  70.3 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  70.17 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  67.44 
 
 		 405 aa  441  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  62.8 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  58.49 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  56.89 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  55.67 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  56.89 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  56.89 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  56.89 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  56.89 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  52.37 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  59.16 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  58.64 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  51.79 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  53.65 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  57.45 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  57.29 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  57.03 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  57.03 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  53.33 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  53.65 
 
 		 417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  52.8 
 
 		 410 aa  358  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  50 
 
 		 376 aa  354  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  55.31 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  51.57 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  51.57 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  51.31 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  50.92 
 
 		 399 aa  350  3e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  52.62 
 
 		 390 aa  347  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  48.73 
 
 		 398 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  50.13 
 
 		 399 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  49.03 
 
 		 394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  49.58 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  38.82 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.28 
 
 		 404 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  30.28 
 
 		 404 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  31.05 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  31.05 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  31.05 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  29.11 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  31.05 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  31.05 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  30.49 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  30.05 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.79 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  33.05 
 
 		 413 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.53 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  33.73 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.53 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>