More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3167 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  794    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3762  major facilitator transporter  59.07 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147545  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1617  major facilitator family transporter  62.29 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0640  major facilitator superfamily MFS_1  62.46 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403686  normal  0.404462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  56.75 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108859  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3708  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26110  putative MFS transporter  53.98 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.463026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2688  major facilitator family transporter  49.58 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2421  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0890  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.97 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  34.49 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  35.49 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  35.49 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  35.49 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  35.61 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  35.49 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  34.49 
 
 		 391 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  35.49 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 389 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4299  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  34.22 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  33.96 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  32.4 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  32.99 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  32.91 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  33.69 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  32.89 
 
 		 388 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0867  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 391 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  32.53 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  35 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  32 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  33.42 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  32 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  35.15 
 
 		 388 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 409 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 389 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  31.87 
 
 		 376 aa  162  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  33.16 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  33.16 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  35.15 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  32.17 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  31.23 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  33.16 
 
 		 389 aa  160  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 384 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  31.99 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  33.72 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>