More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3594 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  762    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  34.01 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  33.04 
 
 		 396 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  33.43 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  30.08 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 397 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 418 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.05 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  32.18 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  31.76 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  32.17 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  32.45 
 
 		 396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  32.45 
 
 		 396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  32.45 
 
 		 396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  33.53 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  32.84 
 
 		 395 aa  162  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  32.73 
 
 		 395 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  33.03 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  32.93 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  31.11 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  30.68 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  32.54 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  29.02 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  33.33 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  32.78 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.31 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  31.21 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  30.4 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  29.65 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  31.58 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  30.14 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  30.14 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  29.85 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  30.61 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  30.61 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  30.61 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  30.61 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  30.61 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  30.61 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  30.14 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  30.61 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  30.42 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  30.42 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  30.42 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  31.41 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  30.36 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  31.86 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  30.17 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  30.77 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  29.85 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  30.35 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  29.85 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  29.85 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  30.58 
 
 		 399 aa  147  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  27.59 
 
 		 388 aa  147  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  29.85 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  30.69 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  30.66 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  29.81 
 
 		 402 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  33.25 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  30.68 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 407 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 403 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  31.29 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>