More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0707 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  100 
 
 		 394 aa  764    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  85.05 
 
 		 389 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  49.58 
 
 		 398 aa  322  9.000000000000001e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  45.38 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  48.6 
 
 		 396 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  48.07 
 
 		 396 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  48.33 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  48.33 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  48.33 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  48.33 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  48.33 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  42.93 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  43.08 
 
 		 399 aa  298  8e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  45.82 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  42.58 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  48.17 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  41.34 
 
 		 388 aa  285  9e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  48.73 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  48.45 
 
 		 396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  48.45 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  48.45 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  48.73 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  48.45 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  48.45 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  48.45 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  47.19 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  48.6 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  47.75 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  45.69 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  47.9 
 
 		 395 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  47.47 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  42.86 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  46.91 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  43.1 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  44.41 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  45.14 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  45.25 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  44.16 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  45.17 
 
 		 417 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  49.03 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  43.87 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  43.87 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  43.15 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  43.38 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  43.38 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  33.24 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  33.24 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  31.03 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 407 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  30.6 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  31.27 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  31.08 
 
 		 404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.62 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  31.29 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.62 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.62 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 393 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0150  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0159  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.35 
 
 		 391 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 397 aa  136  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 408 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.83 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0890  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  31.41 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.14 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 390 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 408 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>