More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0159 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0140  major facilitator transporter  98.25 
 
 
400 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0150  major facilitator transporter  100 
 
 
400 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0159  major facilitator transporter  100 
 
 
400 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234917  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  60.61 
 
 
413 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  32.62 
 
 
396 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  30.79 
 
 
394 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  31.95 
 
 
389 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  31.93 
 
 
419 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  31.69 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  30.9 
 
 
388 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  31.67 
 
 
376 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  31.36 
 
 
396 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  32.86 
 
 
394 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  31.36 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  31.36 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  31.36 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  31.36 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  31.58 
 
 
397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  32.58 
 
 
426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  30.68 
 
 
400 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  32.19 
 
 
399 aa  143  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  30.68 
 
 
400 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  30.68 
 
 
451 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 
404 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.63 
 
 
402 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  31.91 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  32.96 
 
 
397 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  28.81 
 
 
398 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  33.23 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  32.87 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.48 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  31.16 
 
 
407 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  31.62 
 
 
394 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  32.41 
 
 
417 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  31.5 
 
 
395 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7927  major facilitator transporter  31.95 
 
 
409 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437479  normal  0.239391 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  31.43 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  31.09 
 
 
383 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  30.23 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.04 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
383 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  32.22 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  29.57 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  32 
 
 
395 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.37 
 
 
391 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.04 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  30.57 
 
 
393 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
402 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.86 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  29.27 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  30.48 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  30.81 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  29.06 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.81 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  34.28 
 
 
409 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  29.27 
 
 
399 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.26 
 
 
404 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  29.3 
 
 
400 aa  127  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 
410 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
406 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
402 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  31.23 
 
 
389 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  29.56 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  29.56 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  29.56 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  29.56 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  29.94 
 
 
388 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  29.12 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  29.56 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  30.41 
 
 
391 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  29.56 
 
 
396 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  29.72 
 
 
400 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  30.46 
 
 
389 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0118  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
433 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.254663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
388 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  29.31 
 
 
396 aa  123  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  31.61 
 
 
389 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  30.06 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  31.43 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  28.04 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
397 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  30.95 
 
 
389 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  30.39 
 
 
400 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.01 
 
 
399 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  30.95 
 
 
389 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  30.39 
 
 
400 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  30.94 
 
 
400 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  30.85 
 
 
400 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  32.58 
 
 
391 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  30.58 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  30.11 
 
 
400 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  33.63 
 
 
389 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  28.81 
 
 
404 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  29 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  35.57 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  29.49 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>