More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0280 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  98.72 
 
 		 391 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  98.72 
 
 		 391 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  100 
 
 		 391 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  98.98 
 
 		 391 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  98.98 
 
 		 391 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  82.95 
 
 		 391 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  71.35 
 
 		 400 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  69.77 
 
 		 400 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  68.65 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  70.05 
 
 		 401 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  68.75 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  71.35 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  69.01 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  64.32 
 
 		 400 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  68.22 
 
 		 398 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  64.32 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  64.06 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  64.06 
 
 		 400 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  64.06 
 
 		 400 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  64.06 
 
 		 400 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  63.54 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  67.89 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  60.94 
 
 		 394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  58.11 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  53.93 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  53.93 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  53.66 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  53.66 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  53.93 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  53.93 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  53.93 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  53.66 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  53.93 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  53.37 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  53.4 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  67.45 
 
 		 317 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  52.88 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  52.36 
 
 		 404 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  52.36 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  50 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  48.03 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  50.27 
 
 		 388 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  49.35 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  49.35 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  50.26 
 
 		 390 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  49.1 
 
 		 390 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  49.1 
 
 		 390 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  49.1 
 
 		 390 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  49.1 
 
 		 390 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  49.1 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  47.4 
 
 		 391 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  47.4 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  50.87 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35900  chloramphenicol resistance protein  44.68 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  47.67 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  47.67 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  47.4 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  47.4 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  47.4 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  47.4 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  46.85 
 
 		 389 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  45.97 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.5 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  47.66 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  41.84 
 
 		 395 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  44.63 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 388 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  44.35 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 397 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  46.18 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>