More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3194 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  100 
 
 
419 aa  827    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  71.65 
 
 
395 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  64.48 
 
 
398 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  67.7 
 
 
393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  65.8 
 
 
396 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  66.23 
 
 
396 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  65.8 
 
 
396 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  65.8 
 
 
396 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  65.8 
 
 
396 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  63.59 
 
 
396 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  65.28 
 
 
396 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  65.28 
 
 
396 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  65.28 
 
 
396 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  65.28 
 
 
396 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  65.28 
 
 
396 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  65.28 
 
 
396 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  65.28 
 
 
396 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  65.28 
 
 
396 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  65.28 
 
 
396 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  63.04 
 
 
396 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  64.86 
 
 
395 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  60 
 
 
407 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  63.31 
 
 
395 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  61.85 
 
 
407 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  62.15 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  55.35 
 
 
398 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  58.4 
 
 
408 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  58.13 
 
 
413 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  58.36 
 
 
399 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  53.83 
 
 
388 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  53.06 
 
 
376 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  55.27 
 
 
405 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  52.91 
 
 
394 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  54.75 
 
 
417 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  52.3 
 
 
399 aa  359  5e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  51.27 
 
 
399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  51.55 
 
 
410 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  52.11 
 
 
397 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  50.78 
 
 
394 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  49.5 
 
 
451 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  50.51 
 
 
400 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  50.52 
 
 
400 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  55.92 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  51.77 
 
 
390 aa  339  5e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  45.82 
 
 
394 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  46.36 
 
 
389 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  44.08 
 
 
396 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  32.01 
 
 
404 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  35.43 
 
 
393 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  34.4 
 
 
391 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 
391 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  34.4 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  31.42 
 
 
397 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  33.7 
 
 
395 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.2 
 
 
418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  33.79 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  30.62 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  31.28 
 
 
415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.62 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.89 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  30.89 
 
 
391 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
415 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  33.05 
 
 
391 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  32.94 
 
 
391 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.76 
 
 
391 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
404 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  30.59 
 
 
408 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  31.9 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  31.9 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.76 
 
 
391 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  33.61 
 
 
404 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  31.9 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  31.9 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  31.9 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
404 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  31.9 
 
 
390 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  30.62 
 
 
391 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  31.37 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  31.61 
 
 
390 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  32.28 
 
 
414 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  33.05 
 
 
394 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  32.04 
 
 
391 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
403 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  31.43 
 
 
404 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  32.48 
 
 
416 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  33.7 
 
 
393 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
397 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  31.1 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  31.9 
 
 
390 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  33.73 
 
 
391 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  32.48 
 
 
391 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  31.1 
 
 
404 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  31.1 
 
 
404 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  31.1 
 
 
404 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  31.1 
 
 
404 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  31.1 
 
 
404 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
412 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.75 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>