More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0906 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  100 
 
 
391 aa  748    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  82.95 
 
 
391 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  82.69 
 
 
391 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  82.69 
 
 
391 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  82.69 
 
 
391 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  82.43 
 
 
391 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  70.65 
 
 
400 aa  525  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  70.57 
 
 
401 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  68.57 
 
 
400 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  69.09 
 
 
397 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  68.04 
 
 
398 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  67.79 
 
 
400 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  66.31 
 
 
404 aa  484  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  71.09 
 
 
403 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  62.86 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  63.12 
 
 
400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  62.69 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  63.28 
 
 
400 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  63.28 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  62.86 
 
 
400 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  62.86 
 
 
400 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  67.36 
 
 
400 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  60.21 
 
 
394 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  56.07 
 
 
415 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  56.59 
 
 
404 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  56.33 
 
 
404 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  56.33 
 
 
404 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  56.33 
 
 
404 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  56.33 
 
 
404 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  56.33 
 
 
404 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  55.81 
 
 
404 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  55.56 
 
 
415 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  55.56 
 
 
404 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  54.78 
 
 
404 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  54.52 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  54.26 
 
 
404 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  57.47 
 
 
409 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  54.01 
 
 
394 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  67.11 
 
 
317 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  56.74 
 
 
396 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  49.22 
 
 
390 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  49.22 
 
 
390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  48.96 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  47.24 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  46.63 
 
 
391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  48.84 
 
 
390 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  48.96 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  48.96 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  48.96 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  48.96 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  45.41 
 
 
391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  47.4 
 
 
391 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  46.37 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  47.52 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  48.18 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  46.61 
 
 
391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  47.66 
 
 
388 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 
397 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  47.34 
 
 
405 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  47.14 
 
 
416 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  47.14 
 
 
391 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35900  chloramphenicol resistance protein  43.77 
 
 
392 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  44.33 
 
 
392 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  44.33 
 
 
389 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  44.07 
 
 
389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  44.07 
 
 
389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  44.07 
 
 
389 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
393 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  47.47 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  44.04 
 
 
389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.65 
 
 
388 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  44.41 
 
 
385 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  44.33 
 
 
389 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  46.02 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  44.82 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  46.02 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  46.02 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  45.05 
 
 
388 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  45.76 
 
 
389 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  44.9 
 
 
389 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  45.76 
 
 
389 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  45.76 
 
 
389 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  45.76 
 
 
389 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  44.78 
 
 
388 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  43.38 
 
 
406 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  45.43 
 
 
392 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 
388 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  41.97 
 
 
408 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  42.67 
 
 
406 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  43.09 
 
 
388 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 
403 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  42.11 
 
 
395 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  46.28 
 
 
387 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 
388 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 
388 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  41.35 
 
 
397 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  41.84 
 
 
395 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  42.2 
 
 
407 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
406 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 
391 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>