More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2073 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  95.74 
 
 		 408 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  100 
 
 		 399 aa  771    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  95.24 
 
 		 413 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  92.48 
 
 		 399 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  74.18 
 
 		 396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  73.25 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  68.92 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  67.89 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  65.64 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  61.94 
 
 		 407 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  57.51 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  57.44 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  57.03 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  58.03 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  57.58 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  58.22 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  51.84 
 
 		 388 aa  371  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  51.79 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  57.82 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  57.82 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  57.82 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  57.82 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  57.82 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  57.82 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  57.82 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  57.82 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  57.82 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  55.29 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  51.9 
 
 		 394 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  51.94 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  51.88 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  51.42 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  53.02 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  49.73 
 
 		 376 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  48.65 
 
 		 451 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  50 
 
 		 400 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  49.75 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  49.23 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  48.6 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  48.2 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  48.6 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  49.16 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  39.52 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 391 aa  163  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 391 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 404 aa  155  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  32.86 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  32.95 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  32.86 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  32.86 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  32.86 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  29.97 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  29.97 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  29.72 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  32.29 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  33.08 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 393 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 415 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  29.24 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 404 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 404 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 404 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  31.62 
 
 		 388 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 404 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 391 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>