More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5451 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  61.71 
 
 		 735 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  47.55 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  49.73 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  40.16 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 		 398 aa  242  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 415 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  41.64 
 
 		 410 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 		 397 aa  190  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 413 aa  182  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  34.05 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 400 aa  173  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 399 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  34.42 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  33.33 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  34.5 
 
 		 409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  34.84 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  32.06 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  30.27 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  30.27 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  30.27 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  30.27 
 
 		 451 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  30.27 
 
 		 451 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  30.27 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  33.79 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  33.79 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  33.79 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  33.79 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  33.79 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  30.66 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  30.18 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  33.63 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  33.23 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.95 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 403 aa  150  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  30.77 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  32.52 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.73 
 
 		 402 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  31.61 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  31.61 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>