More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5955 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  100 
 
 
417 aa  809    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  72.98 
 
 
394 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  72.22 
 
 
394 aa  554  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  73.82 
 
 
400 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  72.22 
 
 
410 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  73.57 
 
 
400 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  73.58 
 
 
451 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  70.13 
 
 
397 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  57.22 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  56.44 
 
 
396 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  54.75 
 
 
419 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  53.21 
 
 
407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  51.8 
 
 
398 aa  356  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  54.09 
 
 
407 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  54.84 
 
 
402 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  51.34 
 
 
396 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  52.83 
 
 
413 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  52.83 
 
 
408 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  51.07 
 
 
396 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  51.07 
 
 
396 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  51.07 
 
 
396 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  51.07 
 
 
396 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  52.99 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  51.86 
 
 
399 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  48.15 
 
 
398 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  52.42 
 
 
395 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  50.39 
 
 
395 aa  322  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  50.7 
 
 
396 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  50.42 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  50.7 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  50.42 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  50.42 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  50.42 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  50.42 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  50.42 
 
 
396 aa  319  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  50.13 
 
 
395 aa  315  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  46.48 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  49.05 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  47.51 
 
 
388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  53.61 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  44.62 
 
 
399 aa  302  9e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  44.77 
 
 
399 aa  299  5e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 
390 aa  297  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  46.28 
 
 
389 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  42.01 
 
 
396 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  44.2 
 
 
394 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  32.19 
 
 
415 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  32.64 
 
 
415 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  32.64 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  32.38 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  32.88 
 
 
396 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  32.72 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
404 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.77 
 
 
391 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  32.04 
 
 
391 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  33.15 
 
 
404 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.77 
 
 
391 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.87 
 
 
418 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  32.33 
 
 
401 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  29.82 
 
 
406 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  33.51 
 
 
400 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  33.51 
 
 
400 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  33.51 
 
 
400 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  33.51 
 
 
400 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  33.51 
 
 
400 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  31.75 
 
 
404 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  32.96 
 
 
394 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.77 
 
 
391 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  30.41 
 
 
404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  30.41 
 
 
404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  30.41 
 
 
404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  30.41 
 
 
404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.49 
 
 
391 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  30.37 
 
 
404 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  30.41 
 
 
404 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
402 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.27 
 
 
404 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  28.53 
 
 
397 aa  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.64 
 
 
400 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  31.27 
 
 
415 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  32.07 
 
 
391 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.71 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
415 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  30.25 
 
 
407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  30.81 
 
 
391 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  30.62 
 
 
398 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  29.56 
 
 
410 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
410 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.82 
 
 
391 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
391 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  35.74 
 
 
395 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
403 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  32.1 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.39 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  28.17 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  29.87 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  29.81 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  29.81 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  29.53 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>