More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3611 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  97.8 
 
 
410 aa  752    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
410 aa  808    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  64.71 
 
 
398 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  66.06 
 
 
400 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  63.59 
 
 
407 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  59.8 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  61.52 
 
 
411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  58.85 
 
 
402 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  63.24 
 
 
376 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  61.58 
 
 
404 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  58.91 
 
 
397 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  61.43 
 
 
404 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  61.84 
 
 
408 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  60.32 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  60.32 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  52.78 
 
 
404 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  55.61 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  53.96 
 
 
403 aa  396  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  50.88 
 
 
402 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  59.74 
 
 
402 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  56.76 
 
 
409 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  54.91 
 
 
402 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  54.21 
 
 
408 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  54.09 
 
 
420 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  54.08 
 
 
402 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 
396 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  47.75 
 
 
433 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  47.16 
 
 
398 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  47.16 
 
 
398 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  46.24 
 
 
394 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
395 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  40.66 
 
 
401 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  39.09 
 
 
396 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  41.85 
 
 
413 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  44.01 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 
403 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  37.89 
 
 
400 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  46.43 
 
 
376 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
403 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  43.63 
 
 
379 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  39.19 
 
 
451 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  39.19 
 
 
451 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  43.13 
 
 
400 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  39.19 
 
 
451 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  39.19 
 
 
451 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
412 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  42.51 
 
 
403 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  39.19 
 
 
451 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  39.19 
 
 
394 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  43.13 
 
 
400 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  40.58 
 
 
408 aa  259  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  42.98 
 
 
399 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  36.34 
 
 
401 aa  239  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 
397 aa  206  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
412 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.4 
 
 
418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  32.88 
 
 
408 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
402 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  32.88 
 
 
408 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  32.7 
 
 
408 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 
415 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  33.61 
 
 
413 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  36.26 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  31.43 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  32.17 
 
 
406 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  32.05 
 
 
394 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  31.68 
 
 
399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 
402 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
402 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  31.68 
 
 
410 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
390 aa  156  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
398 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
397 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  30.59 
 
 
407 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  29.49 
 
 
417 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
735 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  27.51 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  29.97 
 
 
397 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  30.31 
 
 
392 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
390 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  29.44 
 
 
410 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  29.43 
 
 
397 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  29.34 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  28.77 
 
 
399 aa  133  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  29.51 
 
 
419 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  29.1 
 
 
394 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
387 aa  133  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  27.56 
 
 
404 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  30.79 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  28.53 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  30.04 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  29.73 
 
 
451 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
407 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  29.35 
 
 
399 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  25.8 
 
 
396 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  27.67 
 
 
396 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>