More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1648 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  100 
 
 
396 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  99.24 
 
 
396 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  100 
 
 
396 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  90.66 
 
 
398 aa  698    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  100 
 
 
396 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  99.49 
 
 
396 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  87.88 
 
 
396 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  87.88 
 
 
396 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  87.88 
 
 
396 aa  630  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  87.37 
 
 
396 aa  626  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  65.8 
 
 
419 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  65.68 
 
 
395 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  62.26 
 
 
396 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  64.18 
 
 
395 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  62.44 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  60.87 
 
 
396 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  57.85 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  60.94 
 
 
393 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  54.18 
 
 
376 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  61.09 
 
 
407 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  59.51 
 
 
402 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  53.25 
 
 
398 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  52.93 
 
 
388 aa  389  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  59.18 
 
 
413 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  58.9 
 
 
408 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  59.56 
 
 
405 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  51.55 
 
 
399 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  52.62 
 
 
399 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  58.86 
 
 
399 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  50.9 
 
 
397 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 
390 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  50.96 
 
 
394 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  49.61 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  49.87 
 
 
410 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3070  sugar efflux transporter  56.89 
 
 
399 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  51.97 
 
 
417 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  49.87 
 
 
400 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  49.87 
 
 
451 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  49.61 
 
 
400 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  50 
 
 
389 aa  325  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  48.2 
 
 
394 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  43.87 
 
 
396 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  33.25 
 
 
397 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
404 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  33.33 
 
 
415 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  32.71 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  31.9 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  32.71 
 
 
391 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  33.07 
 
 
415 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  32.15 
 
 
404 aa  179  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  33.07 
 
 
404 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  32.71 
 
 
391 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  32.44 
 
 
391 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  32.44 
 
 
391 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  31.65 
 
 
404 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  31.39 
 
 
404 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  31.39 
 
 
404 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  31.39 
 
 
404 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  31.39 
 
 
404 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  31.14 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  31.9 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  31.65 
 
 
404 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.43 
 
 
404 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
412 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
397 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
402 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  34.4 
 
 
388 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  31.49 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 
388 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  33.06 
 
 
391 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  33.52 
 
 
407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  34.88 
 
 
390 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  32.67 
 
 
392 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
404 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.3 
 
 
418 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  34.88 
 
 
390 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  34.67 
 
 
390 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  34.88 
 
 
390 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  34.88 
 
 
390 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  34.88 
 
 
390 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  34.88 
 
 
390 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  32.45 
 
 
393 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
398 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 
403 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.52 
 
 
390 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  33.42 
 
 
391 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  31.84 
 
 
391 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  33.96 
 
 
391 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  33.53 
 
 
391 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  33.69 
 
 
391 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 
391 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  29.2 
 
 
404 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  30.95 
 
 
415 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.56 
 
 
391 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  31.82 
 
 
389 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>