More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0295 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  98.98 
 
 
391 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  99.49 
 
 
391 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  99.74 
 
 
391 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  98.72 
 
 
391 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  100 
 
 
391 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  82.69 
 
 
391 aa  604  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  70.23 
 
 
400 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  68.92 
 
 
404 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  69.25 
 
 
400 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  70.05 
 
 
401 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  71.88 
 
 
403 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  68.49 
 
 
400 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  67.51 
 
 
398 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  69.01 
 
 
397 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  63.36 
 
 
400 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  63.1 
 
 
400 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  63.36 
 
 
400 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  63.1 
 
 
400 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  63.1 
 
 
400 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  63.1 
 
 
400 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  62.6 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  67.62 
 
 
400 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  60.42 
 
 
394 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  53.37 
 
 
415 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  56.96 
 
 
409 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  53.93 
 
 
404 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  53.93 
 
 
404 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  53.93 
 
 
404 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  53.93 
 
 
404 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  53.93 
 
 
404 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  58.38 
 
 
396 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  53.11 
 
 
415 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  53.14 
 
 
404 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  53.93 
 
 
404 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  53.11 
 
 
404 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  53.11 
 
 
404 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  67.45 
 
 
317 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  52.33 
 
 
404 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  51.81 
 
 
404 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  51.81 
 
 
394 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  50.26 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  50.52 
 
 
388 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  48.21 
 
 
391 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  48.29 
 
 
391 aa  322  8e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  48.18 
 
 
391 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  48.44 
 
 
391 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  49.22 
 
 
388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  47.18 
 
 
391 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  47.92 
 
 
416 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  49.61 
 
 
390 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  47.92 
 
 
391 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  49.61 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  49.35 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  49.35 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  49.35 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  49.35 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  49.35 
 
 
390 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  50.26 
 
 
390 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  51.16 
 
 
391 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  47.54 
 
 
397 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  47.12 
 
 
405 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35900  chloramphenicol resistance protein  44.41 
 
 
392 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  44.53 
 
 
389 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  44.53 
 
 
389 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  44.27 
 
 
389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  44.27 
 
 
389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  46.15 
 
 
389 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
392 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  47.67 
 
 
389 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  47.67 
 
 
389 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  47.67 
 
 
389 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  47.4 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  47.4 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  47.4 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  47.4 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  46.58 
 
 
389 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
393 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 
403 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
393 aa  269  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  42.66 
 
 
407 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.81 
 
 
388 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  43.22 
 
 
406 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  45.26 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  41.82 
 
 
389 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  44.65 
 
 
407 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  41.73 
 
 
408 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  47.38 
 
 
387 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  46.24 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  42.86 
 
 
385 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  41.08 
 
 
397 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  44.35 
 
 
388 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  44.08 
 
 
388 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  42.6 
 
 
406 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  41.58 
 
 
395 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  41.58 
 
 
395 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  46.18 
 
 
400 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 
388 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  43.79 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  45.87 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 
406 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>