More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0228 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  100 
 
 
390 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  100 
 
 
390 aa  737    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  99.74 
 
 
390 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  99.74 
 
 
390 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  94.1 
 
 
390 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  99.74 
 
 
390 aa  735    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  100 
 
 
390 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  100 
 
 
390 aa  737    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  84.17 
 
 
391 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  83.68 
 
 
391 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  83.33 
 
 
391 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  81.33 
 
 
391 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  83.33 
 
 
416 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  83.33 
 
 
391 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  82.23 
 
 
391 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  79.63 
 
 
388 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  77.55 
 
 
388 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  79.1 
 
 
392 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  60.53 
 
 
389 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  61.05 
 
 
389 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  61.05 
 
 
389 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  60.53 
 
 
389 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  62.47 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  62.47 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  62.72 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  62.47 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  62.47 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  62.21 
 
 
389 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  62.47 
 
 
389 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  62.47 
 
 
389 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  61.05 
 
 
389 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  56.91 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  59.24 
 
 
388 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  58.15 
 
 
388 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  55.85 
 
 
408 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  58.9 
 
 
405 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 
397 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  53.68 
 
 
392 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  61.32 
 
 
393 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  57.42 
 
 
388 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  56.3 
 
 
387 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  57.7 
 
 
388 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  54.96 
 
 
388 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  56.94 
 
 
385 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  57.58 
 
 
389 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  54.32 
 
 
412 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  53.89 
 
 
388 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  57.14 
 
 
384 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  57.95 
 
 
386 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  57.95 
 
 
386 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  57.95 
 
 
386 aa  358  7e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  54.74 
 
 
406 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  52.3 
 
 
391 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  52.32 
 
 
406 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  53.55 
 
 
400 aa  345  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  56.58 
 
 
388 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  52.91 
 
 
400 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  53.54 
 
 
400 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  52.91 
 
 
400 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  53.49 
 
 
400 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  56.58 
 
 
388 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  53.89 
 
 
391 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  51.27 
 
 
396 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  54.91 
 
 
391 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 
391 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  51.52 
 
 
407 aa  339  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  52.99 
 
 
400 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  52.73 
 
 
409 aa  339  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  48.68 
 
 
388 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  52.99 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  51.54 
 
 
378 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  52.37 
 
 
406 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  53.01 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  49.61 
 
 
391 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  49.35 
 
 
391 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.68 
 
 
388 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  49.1 
 
 
391 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  49.35 
 
 
391 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  53.3 
 
 
392 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  49.35 
 
 
391 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  49.74 
 
 
400 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  51.19 
 
 
408 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  51.88 
 
 
404 aa  319  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 
391 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  51.72 
 
 
391 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  51.72 
 
 
391 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  52.57 
 
 
390 aa  315  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  52.01 
 
 
395 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  51.56 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  50.56 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  50.28 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  55.09 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  52.07 
 
 
400 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  49.1 
 
 
400 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  48.59 
 
 
391 aa  311  9e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  46.84 
 
 
430 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  50.99 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  48.96 
 
 
391 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
393 aa  308  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>