More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7927 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7927  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437479  normal  0.239391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0384  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5394  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326407  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 408 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5751  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  40.88 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  36.03 
 
 		 390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  36.03 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  36.03 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  36.03 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  36.03 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  37.6 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  34.42 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  35.29 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  35 
 
 		 391 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 416 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  33.5 
 
 		 430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 407 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  34.89 
 
 		 411 aa  179  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 389 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  35.82 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04270  arabinose efflux permease family protein  38.11 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  35.16 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 400 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  31.03 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  31.57 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5596  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 380 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 403 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.92 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  31.46 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  32.97 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  35.22 
 
 		 395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  35.81 
 
 		 416 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 395 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  36.07 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108859  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  32.5 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  33.98 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  32.85 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3237  transporter of the MFS superfamily  30.68 
 
 		 380 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24770  arabinose efflux permease family protein  35.07 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  33.43 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  31.94 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  33.51 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  30.62 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  35.42 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>