More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0829 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  93.3 
 
 
406 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  81.79 
 
 
407 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  70.88 
 
 
406 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  54.81 
 
 
393 aa  352  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  54.85 
 
 
392 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  53.57 
 
 
388 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  52.88 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  52.88 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  52.88 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  53.02 
 
 
388 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  52.88 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  49.25 
 
 
391 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  52.88 
 
 
390 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  49.63 
 
 
391 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  52.88 
 
 
390 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  52.6 
 
 
390 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
392 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  53.78 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  50.66 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  50.66 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  50.4 
 
 
416 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  50.4 
 
 
391 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  50.92 
 
 
391 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  50.28 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  49.44 
 
 
388 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 
388 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 
393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  48.62 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  54.22 
 
 
408 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  50.69 
 
 
387 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  49.25 
 
 
397 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  50.69 
 
 
384 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  51.53 
 
 
405 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  50 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  50 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  50 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  46.09 
 
 
396 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  47.61 
 
 
395 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 
391 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  50 
 
 
391 aa  295  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  50.85 
 
 
385 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  48.31 
 
 
391 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 
391 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  47.49 
 
 
391 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  51.25 
 
 
388 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2186  major facilitator superfamily MFS_1  54.27 
 
 
396 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  46.81 
 
 
389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  50.97 
 
 
388 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  46.53 
 
 
389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  46.53 
 
 
389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  46.53 
 
 
389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  43.28 
 
 
409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  48.19 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  46.79 
 
 
389 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  45.83 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  46.67 
 
 
400 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  48.96 
 
 
391 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  48.49 
 
 
389 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 
385 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
409 aa  279  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  47.01 
 
 
391 aa  279  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  45.5 
 
 
403 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  44.84 
 
 
408 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  43.72 
 
 
408 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  48.41 
 
 
388 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  44.5 
 
 
391 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  48.44 
 
 
392 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  44.65 
 
 
391 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  49.73 
 
 
389 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  49.73 
 
 
389 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  49.73 
 
 
389 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  49.73 
 
 
389 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  49.73 
 
 
389 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  44.5 
 
 
391 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  49.73 
 
 
389 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  49.73 
 
 
389 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  47.37 
 
 
388 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  41.18 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  44.39 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  40.92 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  40.36 
 
 
395 aa  274  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  44.5 
 
 
391 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  44.04 
 
 
403 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  40.92 
 
 
415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  40.92 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  43.73 
 
 
430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  42.46 
 
 
387 aa  272  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  47.41 
 
 
389 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  40.66 
 
 
404 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  47.03 
 
 
390 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  49.59 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  47.21 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  41.69 
 
 
404 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  40.15 
 
 
404 aa  269  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
404 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
404 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  41.43 
 
 
404 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>