More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4575 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  100 
 
 
414 aa  789    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  83.68 
 
 
382 aa  591  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  71.8 
 
 
416 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  66.51 
 
 
425 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  67.4 
 
 
419 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  67.16 
 
 
411 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  67.41 
 
 
411 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  61.5 
 
 
407 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  58.85 
 
 
407 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  57.49 
 
 
408 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  60.22 
 
 
414 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  54.36 
 
 
409 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  53.03 
 
 
411 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  54.52 
 
 
405 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  55.81 
 
 
405 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  56.86 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  52.03 
 
 
399 aa  352  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  50.13 
 
 
394 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  51.92 
 
 
394 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  50.93 
 
 
394 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  54.9 
 
 
360 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 
414 aa  338  8e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  52.02 
 
 
403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  55.49 
 
 
403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  53.42 
 
 
395 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 
402 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  51.63 
 
 
409 aa  329  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  48.59 
 
 
403 aa  326  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  55.41 
 
 
412 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  51.33 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 
420 aa  315  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  57.66 
 
 
408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  51.15 
 
 
399 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  49.58 
 
 
405 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  48.47 
 
 
423 aa  294  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  54.76 
 
 
409 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  50.97 
 
 
400 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 
392 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  47.26 
 
 
397 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  46.26 
 
 
392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  46.5 
 
 
388 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 
399 aa  285  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  47.74 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  46.37 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  47.74 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  47.74 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  47.74 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  47.74 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
390 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  47.46 
 
 
390 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  47.61 
 
 
390 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  47.58 
 
 
393 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  44.51 
 
 
367 aa  279  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  44.72 
 
 
405 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  43.98 
 
 
391 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  44.82 
 
 
388 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  44.33 
 
 
391 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  43.92 
 
 
391 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 
386 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  44.44 
 
 
403 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  43.24 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  44.17 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  43.27 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  43.54 
 
 
416 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  41.69 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  43.54 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  45.28 
 
 
392 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
397 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  43.6 
 
 
389 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  43.6 
 
 
389 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  41.94 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  46.63 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  42.42 
 
 
407 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  42.42 
 
 
407 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  44.53 
 
 
391 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 
385 aa  266  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 
411 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 
391 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  42.39 
 
 
411 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  43.08 
 
 
389 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  43.08 
 
 
389 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  48.88 
 
 
398 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  38.44 
 
 
388 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
388 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  43.52 
 
 
385 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  43.21 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  45.66 
 
 
390 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  43.12 
 
 
406 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  43.24 
 
 
389 aa  249  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 
388 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 
393 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  43.02 
 
 
388 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  46.74 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  43.87 
 
 
408 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  42.41 
 
 
407 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  45.03 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  44.76 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>