More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0872 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  100 
 
 
425 aa  790    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  78.55 
 
 
416 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  75.06 
 
 
419 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  73.87 
 
 
382 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  66.75 
 
 
414 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  75.25 
 
 
411 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  79.37 
 
 
411 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  65.08 
 
 
407 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  60.2 
 
 
407 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  59.32 
 
 
409 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  59.84 
 
 
408 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  59.5 
 
 
360 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  60.53 
 
 
405 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  58.98 
 
 
399 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  55.14 
 
 
411 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  55.01 
 
 
403 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  55.67 
 
 
405 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  58.47 
 
 
403 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  58.67 
 
 
414 aa  359  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  56.8 
 
 
403 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  54.18 
 
 
394 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  50.75 
 
 
414 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  54.46 
 
 
420 aa  349  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  53.91 
 
 
394 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  54.45 
 
 
394 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  55.53 
 
 
409 aa  342  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  51.32 
 
 
402 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  52.99 
 
 
395 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  57.73 
 
 
412 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  50.66 
 
 
403 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  53.4 
 
 
399 aa  315  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  50.55 
 
 
423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  50.25 
 
 
411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  52.37 
 
 
405 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  58.84 
 
 
408 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  51.82 
 
 
400 aa  299  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  57.1 
 
 
409 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  46.68 
 
 
403 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  49.58 
 
 
397 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  46.42 
 
 
403 aa  296  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  46.93 
 
 
405 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  50.67 
 
 
422 aa  293  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  46.09 
 
 
391 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  46.23 
 
 
430 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  47.61 
 
 
411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  50.71 
 
 
393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  46.63 
 
 
407 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  46.63 
 
 
407 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 
411 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  45.99 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  46.86 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  46.84 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  44.64 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  45.36 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  46.6 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  46.6 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  46.6 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  46.6 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  46.61 
 
 
388 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  46.6 
 
 
390 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  46.6 
 
 
390 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  46.05 
 
 
388 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  45.19 
 
 
391 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  45.45 
 
 
391 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  45.45 
 
 
416 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  41.93 
 
 
399 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  47.98 
 
 
390 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  41.05 
 
 
386 aa  276  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  44.79 
 
 
389 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  47.24 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  44.79 
 
 
389 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  44.79 
 
 
389 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  43.13 
 
 
367 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  44.27 
 
 
389 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  45.97 
 
 
391 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  45.19 
 
 
406 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  44.96 
 
 
385 aa  269  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
388 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  46.89 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  45.19 
 
 
407 aa  266  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  47.83 
 
 
405 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  42.18 
 
 
408 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  49.58 
 
 
389 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 
408 aa  263  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  50 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  44.24 
 
 
388 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  45.57 
 
 
391 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  39.32 
 
 
388 aa  262  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  42.71 
 
 
395 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  45.9 
 
 
390 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 
406 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  47.18 
 
 
385 aa  259  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  43.46 
 
 
388 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  48.42 
 
 
392 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  43.58 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  42.26 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  41.67 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  43.11 
 
 
409 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>