More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16360 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  100 
 
 
409 aa  800    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  73.46 
 
 
399 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  67.83 
 
 
411 aa  494  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  67.99 
 
 
403 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  62.88 
 
 
394 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  63.82 
 
 
394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  62.95 
 
 
394 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  63.06 
 
 
414 aa  465  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  64.32 
 
 
395 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  57.47 
 
 
407 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  54.36 
 
 
414 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  60.55 
 
 
425 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  59.6 
 
 
407 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 
408 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  56.99 
 
 
416 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  53.47 
 
 
419 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  55.65 
 
 
382 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  53.39 
 
 
405 aa  362  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  53.02 
 
 
405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  54.57 
 
 
403 aa  345  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  52.91 
 
 
414 aa  342  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  50.4 
 
 
403 aa  338  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  51.94 
 
 
360 aa  332  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  55.23 
 
 
412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  54.79 
 
 
411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  56.11 
 
 
411 aa  325  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  47.64 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  47.55 
 
 
411 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  47.09 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  49.19 
 
 
409 aa  305  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  54.67 
 
 
408 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  44.6 
 
 
403 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  44.32 
 
 
403 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  44.32 
 
 
405 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  52.98 
 
 
420 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 
411 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  43.24 
 
 
407 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  43.24 
 
 
407 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  42.41 
 
 
411 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  47.93 
 
 
399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  43.87 
 
 
390 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  43.79 
 
 
392 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  44.29 
 
 
390 aa  269  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  43.87 
 
 
390 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  43.87 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  43.87 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  43.87 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  43.87 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  43.87 
 
 
390 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  41.97 
 
 
423 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  46.26 
 
 
400 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
392 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  41.69 
 
 
391 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  44.99 
 
 
367 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 
388 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  41.39 
 
 
391 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.93 
 
 
388 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  41.73 
 
 
391 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  43.54 
 
 
422 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  41.47 
 
 
391 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  42.49 
 
 
395 aa  259  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  43.06 
 
 
388 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  49.03 
 
 
409 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  43.84 
 
 
406 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  41.21 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  41.21 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  42.82 
 
 
407 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  43.42 
 
 
405 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  43.07 
 
 
391 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 
391 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  37.79 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  36.94 
 
 
388 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  41.88 
 
 
391 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  42.17 
 
 
391 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  48.73 
 
 
398 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  39.13 
 
 
401 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 
406 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  43.56 
 
 
430 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  42.15 
 
 
391 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 
386 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  42.37 
 
 
393 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  44.54 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  40.11 
 
 
395 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  40.11 
 
 
395 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  41.33 
 
 
389 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  41.33 
 
 
389 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 
399 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  41.07 
 
 
389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  40.8 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  38.86 
 
 
408 aa  240  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 
388 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  41.37 
 
 
393 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  40.39 
 
 
391 aa  239  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 
388 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 
407 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 
386 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
385 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  40.53 
 
 
389 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>