More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01764 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  100 
 
 
403 aa  785    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  64.66 
 
 
414 aa  502  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  67.99 
 
 
409 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  64 
 
 
411 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  65.15 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  59.54 
 
 
394 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  59.54 
 
 
394 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  59.54 
 
 
394 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  57.83 
 
 
395 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  54.24 
 
 
407 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  55.09 
 
 
425 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  55.7 
 
 
407 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  53.23 
 
 
416 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  52.02 
 
 
414 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  50.5 
 
 
419 aa  349  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  51.73 
 
 
414 aa  349  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  51.71 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  49.12 
 
 
405 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  52.25 
 
 
405 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  51.05 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  51.12 
 
 
360 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  52.49 
 
 
403 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  52.96 
 
 
412 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 
409 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  54.34 
 
 
411 aa  319  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  54.95 
 
 
411 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  49.21 
 
 
403 aa  311  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 
402 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  49.11 
 
 
411 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  44.86 
 
 
403 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  50.53 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  53.25 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  48.29 
 
 
399 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  44.33 
 
 
405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  44.06 
 
 
403 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  43.8 
 
 
403 aa  285  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 
411 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  44.04 
 
 
407 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  44.04 
 
 
407 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  43.78 
 
 
411 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  44.57 
 
 
367 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  42.9 
 
 
423 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 
392 aa  265  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  49.5 
 
 
409 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  43.87 
 
 
422 aa  262  8e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.05 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  49.59 
 
 
398 aa  259  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  43.8 
 
 
471 aa  257  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  37.66 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  42.16 
 
 
407 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  42.42 
 
 
406 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  41.55 
 
 
400 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  42.61 
 
 
390 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  41.32 
 
 
430 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  42.74 
 
 
405 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  39.31 
 
 
395 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  42.05 
 
 
390 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  42.05 
 
 
390 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  42.05 
 
 
390 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  42.05 
 
 
390 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  42.05 
 
 
390 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  42.05 
 
 
390 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  39.58 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  39.05 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 
406 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  41.76 
 
 
390 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  40.11 
 
 
391 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  36.48 
 
 
401 aa  243  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  39.84 
 
 
391 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  39.55 
 
 
392 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  40.89 
 
 
395 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  38.58 
 
 
391 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  39.88 
 
 
386 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  39.84 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  39.84 
 
 
416 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 
397 aa  239  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 
400 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
386 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 
408 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 
400 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  41.1 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  41.33 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 
392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  39.88 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  40.58 
 
 
391 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  43.68 
 
 
389 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 
399 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  32.98 
 
 
388 aa  229  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
389 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
391 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  39.84 
 
 
389 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  36.5 
 
 
408 aa  229  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 
407 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  39.84 
 
 
389 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  39.84 
 
 
389 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  39.84 
 
 
389 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>