More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4926 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  747    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  61.39 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  58.29 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  55.73 
 
 		 409 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  53.59 
 
 		 414 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  55 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  56.75 
 
 		 403 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  52.11 
 
 		 419 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  54.25 
 
 		 416 aa  329  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  57.77 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  53.51 
 
 		 420 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  54.57 
 
 		 407 aa  319  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  46.35 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 		 408 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  50 
 
 		 403 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  47.85 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  51.57 
 
 		 382 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  45.76 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  48.63 
 
 		 411 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  54.95 
 
 		 411 aa  292  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  54.15 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 		 400 aa  285  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  49.31 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  45.6 
 
 		 423 aa  282  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  49.06 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  46.35 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  45.87 
 
 		 394 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  48.86 
 
 		 405 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  46.32 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 399 aa  275  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  44.44 
 
 		 430 aa  272  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  49.73 
 
 		 422 aa  265  8.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.5 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  44.79 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  49.34 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 		 388 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  43.52 
 
 		 390 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 407 aa  255  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  43.52 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  43.52 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  43.06 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.94 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  43.52 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  43.52 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 393 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  46.38 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  42.38 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  47.29 
 
 		 471 aa  249  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 400 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 389 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 389 aa  245  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  41 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 395 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14540  arabinose efflux permease family protein  47.39 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>