More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1527 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  771    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  71.93 
 
 		 409 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  69.44 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  63.45 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  65.18 
 
 		 403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  62.2 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  61.94 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  61.94 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  62.5 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  51.9 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  57.56 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  56.68 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  58.92 
 
 		 425 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  52.91 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  55.17 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  52.39 
 
 		 382 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  53.1 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  52.37 
 
 		 405 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 405 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  51.53 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  55.2 
 
 		 411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  53.45 
 
 		 411 aa  325  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  53.71 
 
 		 403 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 405 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 403 aa  322  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  47.18 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  53.02 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  46.61 
 
 		 411 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  53.44 
 
 		 408 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 411 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  48.95 
 
 		 409 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  48.55 
 
 		 420 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  42.06 
 
 		 423 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  40.7 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  40.85 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  48.27 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  41.71 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  43.21 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  40.46 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 391 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.95 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  40.74 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 408 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 391 aa  226  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  41.76 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 409 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  40.46 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>