More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03315 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  100 
 
 		 367 aa  721    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  47.11 
 
 		 414 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03150  arabinose efflux permease family protein  50.14 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  51.93 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  46.11 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  44.51 
 
 		 414 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  44.81 
 
 		 382 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 		 414 aa  278  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 407 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  44.01 
 
 		 403 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  44.2 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 403 aa  262  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  44.57 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  43.97 
 
 		 425 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 411 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 419 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  42.12 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  44.99 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  42.5 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  41.37 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  43.9 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  41.55 
 
 		 411 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 401 aa  228  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 395 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  42.9 
 
 		 409 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 405 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  37.24 
 
 		 423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  36.31 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  36.31 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  36.31 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  36.31 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  37.5 
 
 		 430 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  36.01 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.88 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  36.31 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  36.89 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 389 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  35.8 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 388 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 391 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 404 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>