More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3560 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  777    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  61.39 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  51.67 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  54.96 
 
 		 409 aa  335  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  51.15 
 
 		 414 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  54.04 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  52.75 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  45.93 
 
 		 414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  50.76 
 
 		 419 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  46.65 
 
 		 409 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  53.37 
 
 		 403 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  49.33 
 
 		 423 aa  308  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  51.92 
 
 		 416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  48.99 
 
 		 403 aa  306  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  51.29 
 
 		 425 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 407 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  51.53 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  48.7 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  49.09 
 
 		 408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  52.09 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 405 aa  286  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  46.52 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  50.5 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  46.8 
 
 		 360 aa  276  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  46.6 
 
 		 422 aa  274  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 		 400 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  51.09 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  52.62 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  51.26 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 403 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 411 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  42.82 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  44.3 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  44.11 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  44.58 
 
 		 471 aa  246  6.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 406 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 407 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.59 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  44.51 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  40.16 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 408 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 406 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  37.37 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  40.79 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  41.36 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  41.36 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  41.36 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  41.36 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  40.06 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 390 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 389 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 		 400 aa  222  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  40.34 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>