More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03150  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 405 aa  759    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  50.14 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 414 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  53.87 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  46.11 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  46.26 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  48.68 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  47.31 
 
 		 407 aa  265  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  50.27 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  46.95 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  50 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  47.3 
 
 		 416 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  39.85 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 		 414 aa  249  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  42.93 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 		 411 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  42.6 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  43.13 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 402 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 399 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  45.74 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  41.08 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 401 aa  217  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  39.72 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  42.22 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  38.42 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 405 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  44.54 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.36 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 		 392 aa  193  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  36.76 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  39.09 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  39.09 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14540  arabinose efflux permease family protein  41.51 
 
 		 440 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 386 aa  186  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  37 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>