More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2254 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  100 
 
 
390 aa  764    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.64 
 
 
388 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  53.07 
 
 
395 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  52.8 
 
 
395 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  55.17 
 
 
393 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  51.86 
 
 
389 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  51.86 
 
 
389 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  51.86 
 
 
389 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  58.09 
 
 
386 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  51.86 
 
 
389 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  51.86 
 
 
389 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  51.86 
 
 
389 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  51.86 
 
 
389 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  52.94 
 
 
400 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  51.86 
 
 
389 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  51.86 
 
 
389 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  52.13 
 
 
404 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  53.35 
 
 
388 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  54.97 
 
 
401 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  54.97 
 
 
401 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  55.36 
 
 
401 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  54.04 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  54.04 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  53.8 
 
 
400 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  54.66 
 
 
401 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 
400 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  52.69 
 
 
401 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  50.7 
 
 
391 aa  342  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  46.61 
 
 
395 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  48.33 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  47.2 
 
 
391 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  48.14 
 
 
391 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  48.14 
 
 
391 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  43.01 
 
 
391 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  43.01 
 
 
416 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  43.01 
 
 
391 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  42.2 
 
 
392 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  42.06 
 
 
391 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  42.47 
 
 
391 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.41 
 
 
388 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  41.94 
 
 
391 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 
388 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  45.04 
 
 
388 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  44.76 
 
 
388 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  45.33 
 
 
389 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  42.47 
 
 
391 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  42.49 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  42.49 
 
 
390 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  42.49 
 
 
390 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  42.49 
 
 
390 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  42.49 
 
 
390 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  42.49 
 
 
390 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  45.38 
 
 
391 aa  282  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  42.49 
 
 
390 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  41.64 
 
 
390 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  39.84 
 
 
408 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
388 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  42.61 
 
 
387 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 
388 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  42.86 
 
 
384 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  42.94 
 
 
385 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  43.84 
 
 
383 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  43.03 
 
 
386 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  43.03 
 
 
386 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  43.03 
 
 
386 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
393 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 
385 aa  262  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  39.73 
 
 
389 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 
391 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  40.93 
 
 
391 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  40.46 
 
 
378 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 
392 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  42.32 
 
 
388 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  42.82 
 
 
405 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  42.32 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 
399 aa  252  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  42.06 
 
 
400 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 
388 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  40.26 
 
 
389 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  42.12 
 
 
388 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 
393 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  39.84 
 
 
389 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  39.56 
 
 
396 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
386 aa  245  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  42.78 
 
 
389 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
389 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  42.78 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  38.03 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  39.58 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  39.58 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
397 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  38.85 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  41.64 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  42.49 
 
 
389 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  42.49 
 
 
389 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  42.49 
 
 
389 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  42.49 
 
 
389 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
391 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  39.71 
 
 
412 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>