More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3051 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  100 
 
 
404 aa  772    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  79.47 
 
 
388 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  77.51 
 
 
395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  77.51 
 
 
395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  77.11 
 
 
393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  77.24 
 
 
400 aa  557  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  72.97 
 
 
386 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  71.24 
 
 
400 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  71.24 
 
 
400 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  69.73 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  63.93 
 
 
389 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  63.93 
 
 
389 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  63.93 
 
 
389 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  63.93 
 
 
389 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  63.93 
 
 
389 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  63.93 
 
 
389 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  63.93 
 
 
389 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  63.93 
 
 
389 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  66.67 
 
 
388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  63.4 
 
 
389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  69.73 
 
 
401 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  69.46 
 
 
401 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  69.73 
 
 
401 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  69.73 
 
 
401 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  71.74 
 
 
408 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  71.43 
 
 
401 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  58.7 
 
 
391 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  58.36 
 
 
391 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  58.36 
 
 
391 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  52.13 
 
 
390 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  58.07 
 
 
391 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  57.07 
 
 
395 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  57.58 
 
 
390 aa  354  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  52.7 
 
 
391 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  54.6 
 
 
389 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  50 
 
 
392 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  51.14 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  50.86 
 
 
388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  51.33 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  51.33 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  51.03 
 
 
390 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  51.33 
 
 
390 aa  302  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  45.94 
 
 
408 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  49.43 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  50 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  51.03 
 
 
390 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  51.03 
 
 
390 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  51.03 
 
 
390 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  51.03 
 
 
390 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  49.43 
 
 
391 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  49.14 
 
 
391 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  49.7 
 
 
391 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  51.01 
 
 
405 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  48.86 
 
 
391 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  48.86 
 
 
416 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 
391 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 
392 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  47.93 
 
 
385 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  46.35 
 
 
412 aa  285  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  49.01 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  45.91 
 
 
391 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  48.73 
 
 
388 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  46.22 
 
 
388 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 
385 aa  279  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  49.71 
 
 
397 aa  280  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 
388 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  45.65 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  48.49 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  48.49 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  48.49 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  46.13 
 
 
389 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  47.84 
 
 
389 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  45.72 
 
 
391 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 
393 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  47.06 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  47.23 
 
 
384 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  46.75 
 
 
386 aa  266  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  46.75 
 
 
386 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  46.75 
 
 
386 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  44.41 
 
 
383 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  47.74 
 
 
389 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 
391 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  44.71 
 
 
392 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  43.52 
 
 
378 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  46.22 
 
 
387 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  47.09 
 
 
389 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  47.09 
 
 
389 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  47.09 
 
 
389 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  47.09 
 
 
389 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  43.67 
 
 
403 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  46.8 
 
 
389 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  46.8 
 
 
389 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  46.8 
 
 
389 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  46.8 
 
 
389 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  42.04 
 
 
391 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  44.88 
 
 
406 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  41.49 
 
 
391 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  41.51 
 
 
391 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  41.51 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  48.15 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>