More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5951 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  100 
 
 
392 aa  740    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  63.68 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  62.85 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  58.29 
 
 
406 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  54.71 
 
 
391 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  53.61 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  54.21 
 
 
391 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  53.56 
 
 
391 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  53.3 
 
 
416 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  53.3 
 
 
391 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  53.11 
 
 
392 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  54.44 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  54.44 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  54.44 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  54.44 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  54.44 
 
 
390 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  54.97 
 
 
390 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  54.17 
 
 
390 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  54.17 
 
 
390 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  53.87 
 
 
388 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  52.19 
 
 
388 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 
392 aa  335  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  53.56 
 
 
391 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  49.6 
 
 
389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  49.6 
 
 
389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  54.17 
 
 
393 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  49.34 
 
 
389 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  49.34 
 
 
389 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  48.83 
 
 
400 aa  305  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  50.13 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  52.54 
 
 
386 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  52.54 
 
 
386 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  52.54 
 
 
386 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  46.19 
 
 
409 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  51.39 
 
 
384 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  48.28 
 
 
388 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  48.92 
 
 
406 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  51.39 
 
 
388 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  45.53 
 
 
414 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  51.66 
 
 
389 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  51.66 
 
 
389 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  44.59 
 
 
396 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  51.41 
 
 
389 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  51.41 
 
 
389 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  51.41 
 
 
389 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  50.83 
 
 
388 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  51.41 
 
 
389 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  51.41 
 
 
389 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  48.14 
 
 
412 aa  288  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  51.72 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  47.07 
 
 
385 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  46.37 
 
 
395 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  48.44 
 
 
407 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 
393 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  45.62 
 
 
389 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  46.79 
 
 
395 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  47.77 
 
 
388 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  40.94 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  44.1 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  46.52 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  41.99 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  47.99 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  40.94 
 
 
404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 
391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  45.03 
 
 
391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  41.47 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  48.5 
 
 
389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  41.21 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  48.06 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  41.73 
 
 
394 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  44.91 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  48.11 
 
 
400 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  50.55 
 
 
387 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  40.68 
 
 
415 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  40.68 
 
 
404 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  46.5 
 
 
400 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  44.82 
 
 
408 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  44.65 
 
 
391 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  47.55 
 
 
400 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  45.88 
 
 
391 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  41.21 
 
 
404 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  41.21 
 
 
404 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  41.38 
 
 
404 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  41.21 
 
 
404 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  47.48 
 
 
388 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  41.21 
 
 
404 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  47.29 
 
 
400 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  47.15 
 
 
391 aa  279  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  44.65 
 
 
391 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  44.13 
 
 
391 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 
404 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  41.73 
 
 
404 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  44.39 
 
 
391 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  47.26 
 
 
400 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  47.26 
 
 
400 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 
385 aa  276  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  48.23 
 
 
407 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  46.01 
 
 
382 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  46.95 
 
 
393 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>