More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4025 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  100 
 
 		 382 aa  722    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  83.68 
 
 		 414 aa  607  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  73.74 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  72.22 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  71.58 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  70.13 
 
 		 411 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  70.13 
 
 		 411 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  63.96 
 
 		 407 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  60.16 
 
 		 407 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  56.81 
 
 		 408 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  54.95 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  55.65 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  57.99 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  59.78 
 
 		 414 aa  358  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  53.3 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  53.91 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  53.02 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  53.3 
 
 		 394 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  54.6 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  56.18 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  52.43 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  54.83 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  48.29 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  51.05 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  51.87 
 
 		 409 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  53.46 
 
 		 420 aa  318  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  50.55 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  56 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  58.19 
 
 		 408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  48.41 
 
 		 411 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  50.93 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  44.81 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  44.54 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 399 aa  284  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  45.97 
 
 		 423 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  46.51 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 		 388 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  46.48 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  45.76 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  45.76 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  45.76 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  45.76 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  48.15 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 403 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 391 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 416 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 392 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 389 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 391 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  42.44 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 411 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 407 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 407 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  40.54 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 388 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 389 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  44.65 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  44.59 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  44.59 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  44.59 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  39.84 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  44.59 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>