More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13230 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 423 aa  811    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  65.21 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  57.72 
 
 		 408 aa  401  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  53.59 
 
 		 399 aa  342  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  46.52 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 		 402 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 403 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  49.73 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  49.1 
 
 		 409 aa  317  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  49.87 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  47.36 
 
 		 414 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  46.8 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  49.48 
 
 		 416 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  48.23 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  44.91 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 		 408 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  46.05 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  48.24 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  43.88 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  42.64 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  49.56 
 
 		 411 aa  272  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  41.89 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  47.49 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 412 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 		 400 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 388 aa  259  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  40.73 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  40.73 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  40.73 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  40.73 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 392 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  44.48 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  43.3 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  40.45 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  42.37 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14540  arabinose efflux permease family protein  44.11 
 
 		 440 aa  256  7e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  40.59 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  40.45 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 414 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 395 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  42.38 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  43.5 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 391 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 408 aa  246  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  40.41 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.76 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 390 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 416 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 400 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  43.08 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 411 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  40.25 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  42.12 
 
 		 388 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  42.12 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  42.66 
 
 		 408 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  43.35 
 
 		 401 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>