More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2225 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
392 aa  742    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  65.58 
 
 
423 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  54.32 
 
 
408 aa  355  8.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  53.57 
 
 
409 aa  330  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  53.46 
 
 
399 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  50.66 
 
 
422 aa  317  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  51.69 
 
 
403 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  53.11 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  52.09 
 
 
411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  47.14 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  50.42 
 
 
407 aa  309  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  47.71 
 
 
402 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  50.27 
 
 
420 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  46.56 
 
 
430 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  48.32 
 
 
416 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  48.21 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  49.32 
 
 
425 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  45.82 
 
 
414 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  45.9 
 
 
419 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 
388 aa  272  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  44.79 
 
 
393 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  42.29 
 
 
392 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
399 aa  269  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  42.11 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  41.95 
 
 
388 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 
414 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  46.39 
 
 
399 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  41.99 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  46.81 
 
 
414 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 
405 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  42.78 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  40.79 
 
 
391 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  41.71 
 
 
391 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  41.24 
 
 
407 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  44.35 
 
 
409 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  41.91 
 
 
390 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  41.44 
 
 
391 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  41.44 
 
 
416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  50.41 
 
 
409 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  41.91 
 
 
390 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  41.91 
 
 
390 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  41.62 
 
 
390 aa  259  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  41.91 
 
 
390 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  41.91 
 
 
390 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  42.28 
 
 
403 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  41.91 
 
 
390 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
408 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  41.41 
 
 
406 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  41.62 
 
 
390 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  45.08 
 
 
382 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 
400 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 
407 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  43.8 
 
 
407 aa  255  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  43.14 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  42.86 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  38.18 
 
 
388 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  44.41 
 
 
405 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  41.94 
 
 
394 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  44.94 
 
 
471 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 
392 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  42.28 
 
 
394 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  42.46 
 
 
394 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  43.75 
 
 
360 aa  249  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
388 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  42.18 
 
 
391 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  41.71 
 
 
411 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
388 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 
411 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  41.12 
 
 
384 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  40.93 
 
 
403 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  40.93 
 
 
403 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  40.59 
 
 
387 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  45.51 
 
 
411 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  43.14 
 
 
405 aa  242  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  40.93 
 
 
405 aa  242  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  41.55 
 
 
412 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  41.3 
 
 
407 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  40.26 
 
 
395 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  41.3 
 
 
407 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  41.38 
 
 
389 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  37.94 
 
 
408 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 
411 aa  239  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 
412 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 
397 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14540  arabinose efflux permease family protein  44.65 
 
 
440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  38.46 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  39.83 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 
391 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  44.57 
 
 
389 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
393 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  39.88 
 
 
385 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  39.55 
 
 
391 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  42.02 
 
 
395 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  42.07 
 
 
405 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  38.7 
 
 
383 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  40.59 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  40.59 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>